综合保护中心（Center for Integrative Conservation，简称CIC）成立于2012年，是集合版纳园内热带物种保护与生态系统研究的科研人员组建而成。它旨在将生态学、生物地理学、气候变化生物学、系统学、基因组学、遥感和空间建模等学科的最新技术结合和协调成有效的生物保护工具。中心主要关注中国热带地区和东南亚地区，也致力于为国家和国际保护策略建言献策。

       2018年综合保护中心（以下简称“中心”）有固定人员33人，包括研究员9人。现任中心主任为高力行研究员。截至2018年12月1日，中心在读研究生有54名，其中博士研究生26名，硕士研究生28名，其中在读外籍学生22名。在站博士后10名。2018年共有毕业生8名，包括3名博士研究生，5名硕士研究生。博士后出站3名。

       2018年度，中心在研项目36个，总合同经费为2470.39万元，当年到位经费为686.45万元；国际合作项目6个，总合同经费为269.18万元。

       2018年度发表标注综合保护中心的论文76篇，其中标注中心为第一署名单位的SCI论文31篇，与其他实验室或机构合作SCI论文41篇，发表于国内期刊的文章16篇。标注综合保护中心为第一署名单位的SCI论文累计影响因子为141.57，其中67.7%属于Q1区间期刊，19.4%属于Top10期刊。